prot设计模式，protac设计

分子对接简明教程

1、打开Open Babel软件，找到刚才的resultpdbqt，写好输出的pdb文件名，然后点击CONVERT按钮即可完成转换。

2、MOE分子对接教程在MOE窗口open打开一个有小配体的蛋白（PDB或moe文件）点击Compute→prepare→Protonate3D（使质子化）点击OK。打开SEQ面板删去水分子和与小配体无关的其他杂配体或离子在MOE窗口右边点击SiteView点击System，改变配体颜色使得小配体显示绿色C骨架在MOE窗口点击Surface→recepter在MOE。

3、注：在windows下，我们可以手动选择，或者利用Excel的筛选功能。在Linux下，使用命令egrep ^(ATOM|TER) 1hsg.pdb 1hsg_prot.pdb 启动AutoDockTools 依次点选File-ReadMolecule-1hsg_prot.pdb加载蛋白分子。

4、找出潜在的活性化合物和关键的结合位点。同时，还可以将对接结果与实验数据进行比较，验证模型的准确性和可靠性。总之，通过本教程的指导，读者可以掌握SYBYL软件中分子对接的基本操作和关键步骤。在完成对接后，还需要对结果进行仔细的分析和评估，以发现新的药物候选物和揭示分子相互作用的机制。

相关问答

Q1: 高通量测序数据公共数据库有哪些(高通量测序常规)

1、silva最好，其次greengene（很久没更新了），rdp官网也提供数据库；还有ncbi 提供了人工矫正过的16s database。

2、Q30：高质量碱基比例，影响读长和分析准确性。比对率：与参考序列的匹配程度，高比对率保证分析可靠性。覆盖度：均匀覆盖是准确分析的基础。在构建文库时，无PCR过程可降低偏差，重复率要求在10%以下，以保证数据一致性。

3、同时，也有许多水稻的全长cDNA序列被测定并上传到公共数据库中，如NCBI、EnsemblPlants和GRIN-Global等，可以在这些数据库上下载水稻的cDNA序列数据。进行转录组测序：从水稻植株中提取RNA，然后利用反转录酶合成cDNA，再进行高通量测序，获得水稻的转录组数据，最终得到水稻的cDNA序列。

4、高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（Next-generation sequencing technology），或大规模平行测序（Massively parallel sequencing，MPS）。

5、Illumina公司的Solexa测序平台，目前主流的型号的HiSeq-2500，以及Hiseq-2000，数据通量在每张Flow cell 300G数据，每次最多可以上2张Flow cell，单张Flow cell运行时间大约在11天左右。读长通常是100BP，据说近期有了长度上的突破。

Q2: 干货集锦——20个最佳Bootstrap着陆页模板,快速网页设计不是事儿

SukcesSukces是一款功能强大的HTML5 / CSS3个人简历网站着陆页模板，适合所有人群，无论是自由职业者，设计师，摄影师，还是其他任何行业人群都可以使用该模板快速设计网页。该模板是基于Bootstrap 3框架，具有完全响应式的设计，因此在任何设备上都可以完美展现。

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Q3: protel99se与win10系统不兼容怎么办?

1、protel99se在win10经常死机：方法一：首先右键软件exe，打开“属性”接着进入上方“兼容性”并勾选“以兼容模式运行这个程序”然后将下面的系统改为“Windowsxp（ServicePack2）”并保存。

2、第一步打开99se软件点击左上角箭头，选择 Security...选项 第二步，打开Locks对话框里面的五张门。

3、win10和win7都不支持在PROTEL99SE软件打开界面直接添加元件库。

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