Dynamic Time Warping 动态时间规整算法

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转自：http://www.cnblogs.com/luxiaoxun/archive/2013/05/09/3069036.html

Dynamic Time Warping（DTW）是一种衡量两个时间序列之间的相似度的方法，主要应用在语音识别领域来识别两段语音是否表示同一个单词。

1. DTW方法原理

在时间序列中，需要比较相似性的两段时间序列的长度可能并不相等，在语音识别领域表现为不同人的语速不同。而且同一个单词内的不同音素的发音速度也不同，比如有的人会把“A”这个音拖得很长，或者把“i”发的很短。另外，不同时间序列可能仅仅存在时间轴上的位移，亦即在还原位移的情况下，两个时间序列是一致的。在这些复杂情况下，使用传统的欧几里得距离无法有效地求的两个时间序列之间的距离（或者相似性）。

DTW通过把时间序列进行延伸和缩短，来计算两个时间序列性之间的相似性：

如上图所示，上下两条实线代表两个时间序列，时间序列之间的虚线代表两个时间序列之间的相似的点。DTW使用所有这些相似点之间的距离的和，称之为归整路径距离(Warp Path Distance)来衡量两个时间序列之间的相似性。

2. DTW计算方法：

令要计算相似度的两个时间序列为X和Y，长度分别为|X|和|Y|。

归整路径(Warp Path)

归整路径的形式为W=w₁,w₂,...,w_K，其中Max(|X|,|Y|)<=K<=|X|+|Y|。

w_k的形式为(i,j)，其中i表示的是X中的i坐标，j表示的是Y中的j坐标。

归整路径W必须从w1=(1,1)开始，到wK=(|X|,|Y|)结尾，以保证X和Y中的每个坐标都在W中出现。

另外，W中w(i,j)的i和j必须是单调增加的，以保证图1中的虚线不会相交，所谓单调增加是指：

最后要得到的归整路径是距离最短的一个归整路径：

最后求得的归整路径距离为D(|X|,|Y|)，使用动态规划来进行求解：

上图为代价矩阵(Cost Matrix) D，D(i,j)表示长度为i和j的两个时间序列之间的归整路径距离。

3. DTW实现：

matlab代码：

function dist = dtw(t,r)
n = size(t,1);
m = size(r,1);
% 帧匹配距离矩阵
d = zeros(n,m);
for i = 1:n
for j = 1:m
d(i,j) = sum((t(i,:)-r(j,:)).^2);
end
end
% 累积距离矩阵
D = ones(n,m) * realmax;
D(1,1) = d(1,1);
% 动态规划
for i = 2:n
for j = 1:m
D1 = D(i-1,j);
if j>1
D2 = D(i-1,j-1);
else
D2 = realmax;
end
if j>2
D3 = D(i-1,j-2);
else
D3 = realmax;
end
D(i,j) = d(i,j) + min([D1,D2,D3]);
end
end
dist = D(n,m);

C++实现：

dtwrecoge.h

/***dtwrecoge.h*********************************************************************/
#ifndef dtwrecoge_h
#define dtwrecoge_h#include<stdio.h>
#include<math.h>#define DTWMAXNUM 2000
#define MAX(a,b) ((a)>(b)?(a):(b))
#define MIN(a,b) ((a)<(b)?(a):(b))
#define ABS(a) ((a)>0?(a):(-(a)))
#define DTWVERYBIG 100000000.0/*****************************************************************************/
/* DTWDistance，求两个数组之间的匹配距离
/* A,B分别为第一第二个数组，I，J为其数组长度，r为匹配窗口的大小
/* r的大小一般取为数组长度的1/10到1/30
/* 返回两个数组之间的匹配距离,如果返回－1.0，表明数组长度太大了
/*****************************************************************************/
double DTWDistanceFun(double *A,int I,double *B,int J,int r);/*****************************************************************************/
/* DTWTemplate，进行建立模板的工作
/* 其中A为已经建立好的模板，我们在以后加入训练样本的时候，
/* 以已建立好的模板作为第一个参数，I为模板的长度，在这个模板中不再改变
/* B为新加入的训练样本，J为B的长度，turn为训练的次数，在第一次
/* 用两个数组建立模板时，r为1，这是出于权值的考虑
/* temp保存匹配最新训练后的模板，建议temp[DTWMAXNUM]，函数返回最新训练后模板的长度
/* 如果函数返回-1，表明训练样本之间距离过大，需要重新选择训练样本，
/* tt为样本之间距离的阈值，自行定义
/*****************************************************************************/
int DTWTemplate(double *A,int I,double *B,int J,double *temp,int turn,double tt,double *rltdistance);#endif

dtwrecoge.cpp

/*dtwrecoge.cpp**************************************************************/#include "dtwrecoge.h"
double distance[DTWMAXNUM][DTWMAXNUM]; /*保存距离*/
double dtwpath[DTWMAXNUM][DTWMAXNUM]; /*保存路径*//*****************************************************************************/
/* DTWDistance，求两个数组之间的匹配距离
/* A,B分别为第一第二个数组，I，J为其数组长度，r为匹配窗口的大小/* r的大小一般取为数组长度的1/10到1/30
/* 返回两个数组之间的匹配距离,如果返回－1.0，表明数组长度太大了
/*****************************************************************************/
double DTWDistanceFun(double *A,int I,double *B,int J,int r)
{
int i,j;
double dist;
int istart,imax;
int r2=r+ABS(I-J);/*匹配距离*/
double g1,g2,g3;
int pathsig=1;/*路径的标志*/ /*检查参数的有效性*/
if(I>DTWMAXNUM||J>DTWMAXNUM){
//printf("Too big number\n");
return -1.0;
} /*进行一些必要的初始化*/
for(i=0;i<I;i++){
for(j=0;j<J;j++){
dtwpath[i][j]=0;
distance[i][j]=DTWVERYBIG;
}
} /*动态规划求最小距离*/
/*这里我采用的路径是 -------
. |
. |
. |
. |
*/
distance[0][0]=(double)2*ABS(A[0]-B[0]);
for(i=1;i<=r2;i++){
distance[i][0]=distance[i-1][0]+ABS(A[i]-B[0]);
}
for(j=1;j<=r2;j++){
distance[0][j]=distance[0][j-1]+ABS(A[0]-B[j]);
} for(j=1;j<J;j++){
istart=j-r2;
if(j<=r2)
istart=1;
imax=j+r2;
if(imax>=I)
imax=I-1; for(i=istart;i<=imax;i++){
g1=distance[i-1][j]+ABS(A[i]-B[j]);
g2=distance[i-1][j-1]+2*ABS(A[i]-B[j]);
g3=distance[i][j-1]+ABS(A[i]-B[j]);
g2=MIN(g1,g2);
g3=MIN(g2,g3);
distance[i][j]=g3;
}
} dist=distance[I-1][J-1]/((double)(I+J));
return dist;
}/*end DTWDistance*//*****************************************************************************/
/* DTWTemplate，进行建立模板的工作
/* 其中A为已经建立好的模板，我们在以后加入训练样本的时候，
/* 以已建立好的模板作为第一个参数，I为模板的长度，在这个模板中不再改变
/* B为新加入的训练样本，J为B的长度，turn为训练的次数，在第一次
/* 用两个数组建立模板时，r为1，这是出于权值的考虑
/* temp保存匹配最新训练后的模板，建议temp[DTWMAXNUM]，函数返回最新训练后模板的长度
/* 如果函数返回-1，表明训练样本之间距离过大，需要重新选择训练样本，
/* tt为样本之间距离的阀值，自行定义
/* rltdistance保存距离，第一次两个数组建立模板时可以随意赋予一个值，
/* 后面用前一次返回的值赋予该参数
/*****************************************************************************/
int DTWTemplate(double *A,int I,double *B,int J,double *temp,int turn,double tt,double *rltdistance)
{
double dist;
int i,j;
int pathsig=1;
dist=DTWDistanceFun(A,I,B,J,(int)(I/30));
if(dist>tt){
printf("\nSample doesn't match!\n");
return -1;
} if(turn==1)
*rltdistance=dist;
else{
*rltdistance=((*rltdistance)*(turn-1)+dist)/turn;
}
/*寻找路径,这里我采用了逆向搜索法*/
i=I-1;
j=J-1;
while(j>=1||i>=1){
double m;
if(i>0&&j>0){
m=MIN(MIN(distance[i-1][j],distance[i-1][j-1]),distance[i][j-1]);
if(m==distance[i-1][j]){
dtwpath[i-1][j]=pathsig;
i--;
}
else if(m==distance[i-1][j-1]){
dtwpath[i-1][j-1]=pathsig;
i--;
j--;
}
else{
dtwpath[i][j-1]=pathsig;
j--;
}
}
else if(i==0){
dtwpath[0][j-1]=pathsig;
j--;
}
else{/*j==0*/
dtwpath[i-1][0]=pathsig;
i--;
}
}
dtwpath[0][0]=pathsig;
dtwpath[I-1][J-1]=pathsig; /*建立模板*/
for(i=0;i<I;i++){
double ftemp=0.0;
int ntemp=0;
for(j=0;j<J;j++){
if(dtwpath[i][j]==pathsig){
ftemp+=B[j];
ntemp++;
}
}
ftemp/=((double)ntemp);
temp[i]=(A[i]*turn+ftemp)/((double)(turn+1));/*注意这里的权值*/
} return I;/*返回模板的长度*/
}//end DTWTemplate