r语言与go混合编程，r语言编程题

嵌套Venn图的绘制(R语言)

绘制韦恩图有很多方式，R，Python，Perl等，这里主要是用R来展示；在R语言中，绘制venn图有很多包可以实现：Venn， Vennplot， VennDiagram， VennDetail， ggvenn，gplots等。此文主要展示一下用VennDiagram包绘制高纬度的韦恩图。

接下来，将该文件读到R中，绘制Venn图。VennDiagram包中的函数venn.diagram()，可以直接基于原始数据自动统计并绘制Venn图。工作路径下输出一张图片“vennpng”，打开就是绘制的Venn图。

参数：VennDiagram函数包最大能绘制5个数据集合的韦恩图。

韦恩图(Venn diagram)是集合论(或类的理论)的数学分支，用来表示不那么严格的集合(或类)的草图。

最简单的方法是用PPT画出不同的圈圈，然后标上数字。如果想让不同交集的尺寸随着数字的大小而调整，可能需要花上一点功夫。 这里有一个一劳永逸的方法（Vennerable package），轻松获得和高水平文章上类似的Venn（维恩）图。

文氏图(英语：Venn_iagram)，或译Venn图、温氏图、维恩图、范氏图，是在所谓的集合论(或者类的理论)数学分支中，在不太严格的意义下用以表示集合(或类)的一种草图。

相关问答

Q1: R语言程序跑一千万大概多久

1、不久，基本都是秒结束。除非你的数据量很大，或者算法很复杂。再有就是在循环过程中与数据的结构类型也有关系。

2、分钟。随机森林具有很高的预测准确率，对异常值和噪声具有良好的容忍度，需要5分钟才能跑完，且不会随着构建的决策树的增加而出现过拟合现象。但在引用随机森林方法时，也会产生一定限度内的泛化误差。

3、写r语言对cpu有一定的要求，但是对内存的要求还是比较大的。如果说你想用电脑进行程序的编程，电脑的最低配置，现在来讲也要达到I5的CPU，8G的内存最好能再配一个独立显卡，这样效果才最理想。

4、r语言是统计用的，c语言是一种计算机高级语言，可以写各种程序。其实两者不是一个层面的东西，r语言更像是一种应用程序提供的功能，如果非要分个难易，在你用来搞统计的情况下，r语言应该要容易一些。

5、R的占用空间很小的，一般来说安装R和R studio总共加起来占用不到1个G的空间。主要是在跑数据比较大的时候，运行内存和系统会比较难带起来。

Q2: 如何将R语言代码导出

输入你的GO号码，就能出来了，还能下载。你还可以根据你的需要进行过滤，比如注释的来源，物种等等。希望能对你有所帮助。

R代码是指使用R语言时书写的代码。R是一套完整的数据处理、计算和制图软件系统。

能，一般的导出比如write.table(listName，file=)就行，如果你想导出list里面某一个属性的值，就用listName$name 就行。

Q3: R语言KEGG相关,请战友们帮我看看是怎么回事

1、我们知道R的版本在不停的更新，相应的R包也在不停的更新。我把绘制气泡图和柱形图相关的函数拿出来认真的研究了一下，终于发现的症结所在。

2、关键还在于感兴趣点在哪了。粗略的看，可以先看KEGG或者GO功能分类，看差异基因具体富集在哪些通路或功能。比如关注的是细胞内酸合成关键酶，可以重点看酸合成和碳流相关通路。具体如何看KEGG或者GO功能分类，请听下回分解。

Q4: 学习经济学需要熟悉哪些编程语言

Stata：计量经济学。SPSS：专门开的一门课，这个巨汗，权当复习了一遍统计学。Excel：大一的统计入门课使用的，这个也巨坑，就是简单的函数使用，一点没有涉及VBA。

都很有用，C/C++用于处理海量数据和高速运算。

学习经济学，要有数学知识的准备是：微积分（从极限的定义开始，一直到多重积分）。概率论（非连续的、连续的各种概率模型、各种密度函数、概率函数、贝叶斯先验后验等等）。

C++的语法跟VB的其实不是很像，但是众所周知编程语言的语法再怎样都差不多，你只要理解了编程的基本概念，从一个语言转到另一个语言很容易，再者说，VB真的很容易上手。

R是用于 统计 分析、 绘图的语言和操作环境。R是属于 GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。

Q5: R语言:clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换

对于没有转换的gene ID，clusterProfiler也提供了 bitr 方法进行转换ID：可以看到，这里转换ID的对应文件来源于org.Hs.eg.db这个包。

)检查结果，可见geneID展示为gene symbol。（1）在enrichGO函数中，设置readable = TRUE；(2)用setReadable函数，对GO或者KEGG结果进行转化即可。

最近有粉丝反映说，利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候，发现GO条目的名字都重叠在一起了。气泡图 柱形图 这个图别说美观了，简直不忍直视。经过我的认真研究，发现跟R版本有关。

这样做能避免得出的结论不全面，对于事先没有预想的term或者是事先预想的term不全面这些情况有帮助。

topGO是一个半自动的GO富集包，该包的主要优势是集中了好几种统计检验的方法，目前支持的统计方法如下：BiocManager：install(topGO)需要R的版本为=10，但biocmanager安装需要的R版本更高，现在应该是6。

clusterProfiler是一个功能强大的R包，同时支持GO和KEGG的富集分析，而且可视化功能非常的优秀，本章主要介绍利用这个R包来进行Gene Ontology的富集分析。

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