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windows安装lammps,WINDOWS安装程序无法将WINDOWS配置为
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lammps加载时闪退
所以lammps仿真,找到好的可靠地势能场是关键!当然如果势能场也没问题的话,就有可能是加载边界条件问题了。可以看看模型及盒子是否匹配,周期还是有限边界,看看系统压强是不是过大或者过小。同时选择适当的时间步长,用thermostat时有没有同时开fix nve等也都可能引起问题。
如果加载过快,应变速率(strain rate)过快,现象也会不同;还有如果加载位置不好,材料会扭曲失稳,薄弱的点会被撕裂,这都会出现局部损坏。所以得把模型打出来看。
lammps加载时闪退可能是该软件缓存较多导致无法正常运行,建议清除软件缓存尝试闪退,多指在移动设备(如iOS、Android设备)中或不可移动设备(如:Windows、Linux等设备),在打开或使用应用程序时出现的突然退出中断的情况(类似于Windows的应用程序崩溃)。多表现为:应用程序画面一闪而过,随即退回到桌面。
相关问答
Q1: lammps在windows下的安装问题
不适合大部分人群。大规模原子分子并行模拟器。LAMMPS由美国Sandia国家实验室开发,以GPLlicense发布,即开放源代码且可以免费获取使用,这意味着使用者可以根据自己的需要自行修改源代码。LAMMPS可以支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,并提供支持多种势函数。
各位前辈好,我使用的是 Makefile.mkl。
lammps加载时闪退可能是该软件缓存较多导致无法正常运行,建议清除软件缓存尝试闪退,多指在移动设备(如iOS、Android设备)中或不可移动设备(如:Windows、Linux等设备),在打开或使用应用程序时出现的突然退出中断的情况(类似于Windows的应用程序崩溃)。多表现为:应用程序画面一闪而过,随即退回到桌面。
可以,如果系统安装了mpich,lammps进行并行计算,多增加一个算例,计算时间就多一倍,如果是单线程的lammps,那么你可以算N(计算机核数或线程数)个算例而不影响速度。但是只运行一个算例的话,多线程并行计算的速度是单线程计算速度的N倍。
虽然我没在自己pc上装过lammps,不过感觉应该没必要并行吧,pc计算能力很有限,感觉不适合跑很大的任务,做做模型或者功能测试不错。如果你有集束计算机群的资源可以用,那自然得在那上面装并行的lammps。集束计算机的并行和自己pc的并行有可能不太一样。
Q2: 分子动力学模拟仿真软件及硬件条件,求高人解答。。。
1、lammps软件虽然有很多方便之处,但是它模拟的分子量有限,由于这个软件只有5M左右,经行建模可能有些麻烦,国外有专门的用于分子模拟的软件,这要看你模拟的目的是什么,分为医药、生物、化学、材料等领域,每个领域都有相对专业的软件。比如accelrys materials studio等。
2、Lammps,gromacs,amber都可以啊,不过安装就比较费事,要有教程啥的,如果不想麻烦你可以先去北鲲云超算平台了解一下这些软件,他们平台都是安装好的。
3、x86系统以上。因为vasp动力学模拟服务器需要经过更加专业的处理器进行计算,x86系统以下的硬件无法更加有效快速的处理vasp动力学模拟服务器的数据,需要利用x86系统以上的硬件才能完后才能vasp的数据计算。
4、化工方面必备的软件推荐包括:Material Studio、Aspen、COMSOL Multiphysics、ANSYS和Gaussian。Material Studio是一款广泛应用于材料建模和仿真的软件,特别适用于化工领域。它可以进行分子动力学模拟、量子力学计算等,帮助研究者深入理解材料的性质和行为。
5、个人感觉Lammps入门不那么简单,最好能有学长带你。还是首先看你题目做那个方向,做传热相关还是力学相关? 那种材料?我只知道一点做晶体声子传热仿真的,要看些固态物理,晶格动力学和统计力学的书籍或相关材料。
6、i) sumv2=sumv2+v(i)**2end dosum = sumv/npartfs = sqrt(3*temp/sumv2) ! 速度矫正因子do i=1,npart v(i)=(v(i)-sumv)*fs ! 速度矫正 x(i)=x(i)-v(i)*dt end doreturnend从上面的代码看,公式还是很简单的,你可以对照书上的公式一一对照。
Q3: 如何在lammps中实现将分子的运动固定在某个区域
在windows下也可以运行,不过好像不能做并行计算了,在windows下用DOS就可以用了,在LAMMPS Windows serial executable ,会得到一个lmp_win_no-mpi.exe,我将它放在e:\lammps下。将一个实验用的in.colloid输入文件也放在lammps下,用以测试。
该命令用于定义一个空间几何区域。很多其他命令都会使用该命令定义的区域。
LAMMPS是专门做分子动力学(MD)模拟的程序。它跟蒙卡完全是两种截然不同的方法。简单的蒙卡code规模很小,你可以自己写 —— 需要一个随机数发生器,一个抽样算法(比如metropolis,接近临界时可用swendson-wang),一个构型空间(如离散化的模型)。
Q4: 求助各位前辈帮我看看安装并行安装LAMMPS中的问题
各位前辈好,我使用的是 Makefile.mkl。
大规模原子分子并行模拟器。LAMMPS由美国Sandia国家实验室开发,以GPLlicense发布,即开放源代码且可以免费获取使用,这意味着使用者可以根据自己的需要自行修改源代码。LAMMPS可以支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,并提供支持多种势函数。
如果是 unknown pair style 从error message 看,应该是没装好meam,在 src 文件夹里输入 make package-status,看看有没有把 meam 安装好。
可以,如果系统安装了mpich,lammps进行并行计算,多增加一个算例,计算时间就多一倍,如果是单线程的lammps,那么你可以算N(计算机核数或线程数)个算例而不影响速度。 但是只运行一个算例的话,多线程并行计算的速度是单线程计算速度的N倍。
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