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Python求概率函数 python计算概率分布
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python中简单的概率计算
实验室室间质评项目绕不开的大佬——李金明Python求概率函数,前一段时间看基因谷发了他的PPT(但是水印怎么是基因狐啊喂),正好从中了解些的临床的相关规范(其实Python求概率函数我想找生信相关要点,但好像并没有...)。
说实话,之前在上家做微生物多样性相关科研服务时候,对参数这块定的不是特别死,有时候流程固定参数达不到合同要求交付的测序量,经常会改改overlap,改改最大错配。可能也是因为这种比较低端,pipeline不断,每天流水线式的能交100来个,颇有种来测序、送分析的意思。
简单记录下其中几个概率的计算
题为:平常病人阳性率为10%,一次检测25个标本,求获得6个阳性或6个以上结果的概率,概率为1-(获得0个或1个或2个或3个或4个或5个阳性结果的概率)
注:细看ppt其实是有些小问题的,没有写P(5)
题为:一个实验室中,一个项目每次检测结果阳性率为2%,100个样本中出现8个阳性结果概率
题为:一次检测100个标本的项目中,2个阳性结果连续出现的概率
题为:一次检测100个标本的项目中,3个阳性结果连续出现的概率
注:样本间交叉污染的概率解读
首先假设每次检测样本,是阴性或是阳性都是独立的事件,那么
做n个样本,任意取其中r个,相邻的情况有 n-r+1 种
做n个样本,任意取其中r个,所有情况有 种
P=
假定检测样本的结果都是独立的,那么其r个阳性连续出现概率大于P,则说明r次连续的阳性结果存在正相关,可能是样本间污染(小概率事件在小规模样本数中发生)
那么,当样本数极大时候,如果其r个阳性连续出现概率小于P,那么也能说明r次连续的阳性结果存在负相关,相邻样本间结果存在拮抗(小概率事件在大规模样本数中仍不发生)
李金明:临床基因扩增检测质量保证(PPT全文)
相关问答
Q1: python的rand怎么用
python中的randint用来生成随机数,在使用randint之前,需要调用random库。其表达是为random.randint(x,y),参数x和y代表生成随机数的区间范围。
random() 函数命名来源于英文单词random(随机)。randint是random + integer拼接简写而成,代表随机一个整数。
Python标准库中的random函数,可以生成随机浮点数、整数、字符串,甚至帮助你随机选择列表序列中的一个元素,打乱一组数据等。
函数randint的使用
1、OUT = RANDINT
产生一个“ 0 ”或“ 1 ”等概率。
2、OUT = RANDINT(M)
生成的M 矩阵的随机二进制数字,“ 0 ”和“ 1 ”出现的概率均等。
3、OUT = RANDINT(M,N)
生成的(M,N) 矩阵的随机二进制数字,“ 0 ”和“ 1 ”出现的概率均等。
4、OUT = RANDINT(M,N,RANGE)
生成的(M,N) 矩阵的随机二进制数字,RANGE范围可以是标量或向量。
标量:为正的话,取值为[0,RANGE-1] ,为负的话,取值为 [RANGE+1, 0]。
向量:取值为[RANGE(1), RANGE(2)]。
5、OUT = RANDINT(M,N,RANGE,STATE)
resets the state of RAND to STATE。
Q2: python求概率和是条件应该怎么写
random.seed()用来设置初始值,这里random.seed(0)是从0开始。
random.choice() 用来随机分配,这里表示随机分配从20,20,40,50,60,70里随机分配。
random.random() 用于随机生成从0到1的浮点数,即0=n=1.0。
“_” 是占位符,表示不在意变量的值,用来循环n次。
二、安装python的科学计算包scipy
在python的科学计算包scipy的stats模块计算出常见概率分布的概率值,并用matplotlib包进行绘图。
在notebook环境下安装科学计算包scipy。如果已安装忽略下面安装步骤。
安装步骤:
1)打开终端Anaconda Prompt
2)在conda中运行以下命令:conda install scipy
如果存在多个python环境,先进入想要的环境再安装,比如我自己设置了py2和py3两个环境,先在conda中进入python环境:activate py3,再按上面步骤2执行
如果还没有安装numpy包和matplotlib包,也按上述命令安装这些包
Python求概率函数的介绍就聊到这里吧,感谢你花时间阅读本站内容,更多关于python计算概率分布、Python求概率函数的信息别忘了在本站进行查找喔。








