在python中调用r，在Python中调用jmeter脚本出现乱码

R语言:DNA序列比对后计算遗传距离(P-distance)

在R语言中找到了计算遗传距离的函数dist.dna()；但是不知道在R里面如何利用循环批量处理文件计算遗传距离。想到了利用python来调用R函数的方法，查找相关教程发现需要用到rpy2模块。

利用DNA序列数据计算遗传距离最简单的方法是计算p距离（p-distance），计算式为：p= nd /n，其中 n为所测定序列的核苷酸数，nd 为核苷酸差异数。

当用分子标记作遗传多样性分析时，可用下式：d（i，j）=constant（∑｜Xai-Xaj｜r）1/r，这里Xai为等位基因a在个体i中的频率，n为每个位点等位基因数目，r为常数。

遗传距离是用来衡量物种之间或同一物种的群体之间的遗传差异（基因组差异）的程度，并且以某种数值进行度量。

相关问答

Q1: python中字符串前r的用法疑问

1、在python中，如果未原始字符串，则反斜杠后跟一个字符可以表示一个特殊字符。例如，\n表示换行符，\r表示回车，\t表示制表符，\b表示无损退格键。就其本身而言，\d在python字符串中并不表示任何特殊含义。

2、字母前加r表示raw string，也叫原始字符串常量。

3、pd.read_excel(rC：\Users\a.txt)和pd.read_excel(C：\Users\a.txt)是一样的 声明字符串不需要转义这样就实现了用\来访问路径。而Linux下路径是用/来分割，同样描述路径有两种方式，总是不舒服。

4、Python中字符串前面加上 r 表示原生字符串，与大多数编程语言相同，正则表达式里使用\作为转义字符，这就可能造成反斜杠困扰。

5、“r”是“raw”的简写。去查单词，意思是“未加工的，原料”。因此，不难想象，在python字符串前面，表示“按原样输出字符串”，也就是说字符串里的元素，原来什么样子，还是什么样子，不变。python不会去对一些符号转义。

Q2: python如何调用R

在Python调用R，最常见的方式是使用rpy2模块。

要用rpy2包的数据包，python才能调用R语言。

r.mydose()调用后返回的东西不是报错，是因为mydose这个function返回值就是NULL，所以rpy就相应的返回了rpyrinterface.NULL，没有问题。

Q3: 2020-04-18|python读取文件路径前面加r的原因

pd.read_excel(rC：\Users\a.txt)和pd.read_excel(C：\Users\a.txt)是一样的 声明字符串不需要转义这样就实现了用\来访问路径。而Linux下路径是用/来分割，同样描述路径有两种方式，总是不舒服。

在Python的string前面加上‘r’， 是为了告诉编译器这个string是个raw string，不要转意backslash 。 例如，\n 在raw string中，是两个字符，\和n， 而不会转意为换行符。

-*- utf-8是一种支持中文的编码格式。字母前加r表示raw string，也叫原始字符串常量。

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