（数据科学学习手札66）在ubuntu服务器上部署shiny

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一、简介

shiny是R中专门用于开发轻量级web应用的框架，在本地写一个shiny应用并调用非常方便，但如果你希望你的shiny应用能够以远程的方式提供给更多人来使用，就需要将写好的shiny应用部署到服务器上，主要有两种方式，第一种是将shiny应用发布在shinyapps上，第二种是将你的shiny应用部署到自己租用的服务器上，前者比较方便但遇到一些R包环境或中文显示等问题时几乎是无解的，而后者虽然麻烦，但更为自由，且从0开始自己动手的过程又何尝不是一种极大的乐趣呢，本文就将针对在ubuntu 16.04服务器上部署shiny server的流程进行详细的说明；

二、环境配置

2.1 服务器配置说明

我使用的服务器是阿里云ECS，ubuntu 16.04，2核8G内存，40G系统盘，如果条件允许的话，建议内存不要选择过小，否则在编译安装一些R包如raster时会内存不足（当然你也可以通过swap的方式来增加虚拟内存，但速度是非常慢的），用于连接服务器的工具为putty，通过putty登入服务器：

2.2 安装最新版R

首先我们需要安装最新版的R（写作此文时最新的稳定版本为3.6.1），查看R官网对于ubuntu安装最新版R的介绍：

按照上述步骤，首先用vim打开对应的sources.list文件：

sudo vim /etc/apt/sources.list

按i进入编辑模式，结合我们系统版本，把前面R官网说明页面中的deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35添加进文件中，按esc后，再按shift+:，输入wq完成写入并退出过程：

接着执行下列命令来安装最新版的R，遇到y/n全部选择y：

sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base

这时查看R版本：

这时可以看到我们已经成功安装了最新版本的R。

2.3 安装Rstudio与Rstudio Server

接下来我们来安装Rstudio以及Rstudio Server，用于远程编写及管理服务器上的R程序，在官网对应的下载页面找到对应我们系统版本的geb格式安装包下载链接：

Rstudio：

Rstudio Server：

其实可以在服务器中输入wget 下载链接来下载对应的文件，但是无奈这样下速度太慢，于是我在本地电脑用了梯子之后以很快的速度下载了Rstudio的geb文件，然后用pscp上传到我们的服务器上的指定目录下：

除此之外还需要安装用以打开geb格式文件的相关程序：

sudo apt-get install gdebi

接下来执行下列命令安装Rstudio：

sudo gdebi rstudio-1.2.-amd64.deb

同样的方式，我们用pscp上传Rstudio Server的安装包到刚才的目录下执行下列语句：

sudo gdebi rstudio-server-1.2.-amd64.deb

在完成上述命令后，我们可以通过访问http://你的服务器公网IP:8787来使用Rstudio Server服务：

这里输入的账户和密码与服务器登录账户与密码一致，这里不得不吐槽一下Rstudio Server的傻逼设定，这里登入的账户和密码不能已获取超级用户权限，没关系，我们新建一个没有超级用户权限的用户：

sudo adduser 用户名

这样我们就可以用这个无超级用户权限的账号登入Rstudio Server：

可以看到熟悉的界面，就是个在线版的Rstudio，可以通过它来方便地修改服务器上的R代码。

2.4 安装shiny和shiny server

接下来到了最重要的地方，我们来安装shiny和shiny server，首先我们在服务器上的R环境中安装shiny包：

安装成功：

接下来安装shiny server，同样的在本地从官网下载对应的geb安装包，然后用pscp上传到指定目录下：

执行下列命令来安装shiny server：

sudo gdebi shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb

安装完成后访问 http://服务器公网IP:3838，这是shiny server的默认导引页，若能显示正常则证明shiny server安装成功：

这时可以发现右侧下方的应用没有正常显示，但这里并没有明确显示具体的报错信息，为了在shiny应用出错时能显示具体的错误信息，我们需要修改shiny server的配置文件，执行下列命令打开shiny server的配置文件：

vim /etc/shiny-server/shiny-server.conf

如图所示位置添加上两行语句用于设置shiny应用出错时显示具体错误信息，保存退出，重新访问刚才的页面：

可以看出这时显示的报错信息提示我们缺失rmarkdown包，在R环境中安装rmarkdown后再次访问此页面：

这时可以看到对应的应用都已正常显示，而这两个应用所在的路径在shiny server的配置文件中有说明：

打开对应路径可以看到hello和rmd两个文件夹，每个文件夹代表一个应用，其内部拥有标准的shiny应用的ui.R和server.R，有时也会有global.R来辅助程序运行：

同样的，我们可以修改配置文件中的默认应用路径到我们自己的应用位置，而在管理shiny server运行上，主要用到下列命令：

#查看状态
sudo systemctl status shiny-server
#开启
sudo systemctl start shiny-server
#停止
sudo systemctl stop shiny-server
#重启
sudo systemctl restart shiny-server

而直接访问应用就是在刚才的引导页url后面添加路径信息，如我们直接来访问hello应用，http://服务器公网IP:3838/sample-apps/hello/ ：