玩转 Jupyter Notebook （CentOS）

玩转 Jupyter Notebook （CentOS）

Jupyter Notebook 简介

Jupyter Notebook 是一个开源的 Web 应用程序，可以用来创建和共享包含动态代码、方程式、可视化及解释性文本的文档。其应用于包括：数据整理与转换，数值模拟，统计建模，机器学习等等。更多信息请见官网 。

1. 检查 Python 环境

1.1 查看 Python 版本

CentOS 7.2 中默认集成了 Python 2.7，可以通过下面命令检查 Python 版本：

python --version

1.2 安装 pip

pip 是一个 Python 包管理工具，我们使用 yum 命令来安装该工具：yum -y install python-pip；使用下面命令升级 pip 到最新版本：pip install --upgrade pip

1.3 安装相关依赖

安装 Jupyter 过程中还需要其他一些依赖，我们使用以下命令安装他们：

yum -y groupinstall "Development Tools"

yum -y install python-devel

2. 配置虚拟环境

2.1 安装 virtualenv

我们将为 Jupyter 创建一个独立的虚拟环境，与系统自带的 Python 隔离开来。为此，先安装 virtualenv 库：

pip install virtualenv

2.2 创建虚拟环境

创建一个专门的虚拟环境，并直接激活进入该环境：

virtualenv venv

source venv/bin/activate

2.3 安装 Jupyter

使用pip进行安装：pip install jupyter

3. 配置 Jupyter Notebook

3.1 建立项目目录

我们先为 Jupyter 相关文件准备一个目录：

mkdir /data/jupyter

cd /data/jupyter

再建立一个目录作为 Jupyter 运行的根目录：

mkdir /data/jupyter/root

3.2 准备密码密文

由于我们将以需要密码验证的模式启动 Jupyter，所以我们要预先生成所需的密码对应的密文。

生成密文，使用下面的命令，创建一个密文的密码：

python -c "import IPython;print IPython.lib.passwd()"

执行后需要输入并确认密码，然后程序会返回一个'sha1:...'的密文，我们接下来将会用到它。

3.3 修改配置

3.3.1 生成配置文件

我们使用 --generate-config 来参数生成默认配置文件：

jupyter notebook --generate-config --allow-root

生成的配置文件在 /root/.jupyter/ 目录下，可以点此编辑配置。

3.3.2 修改配置

然后在配置文件最下方加入以下配置：

c.NotebookApp.ip = '*'
c.NotebookApp.allow_root = True
c.NotebookApp.open_browser = False
c.NotebookApp.port = 8888
c.NotebookApp.password = u'刚才生成的密文(sha:...)'
c.ContentsManager.root_dir = '/data/jupyter/root'


其中：c.NotebookApp.password 请将上一步中密文填入此项，包括 sha: 部分。

你也可以直接配置或使用 Nginx 将服务代理到 80 或 443 端口。

4. 启动 Jupyter Notebook

4.1 直接启动

使用以下指令启动 Jupyter Notebook：

jupyter notebook

此时，访问“http://<您的 CVM IP 地址>:8888”即可进入 Jupyter 首页。

4.2 创建 Notebook

进入【首页】首先需要输入前面步骤中设置的密码。

然后点击右侧的【 new 】，选择 Python2 新建一个 notebook，这时跳转至编辑界面。

现在我们可以看到 /data/jupyter/root/ 目录中出现了一个 Untitled.ipynb 文件，这就是我们刚刚新建的 Notebook 文件。我们建立的所有 Notebook 都将默认以该类型的文件格式保存。

4.3 后台运行

直接以 jupyter notebook 命令启动 Jupyter 的方式在连接断开时将会中断，所以我们需要让 Jupyter 服务在后台常驻。

先按下 Ctrl + C 并输入 y 停止 Jupyter 服务，然后执行以下命令：

nohup jupyter notebook > /data/jupyter/jupyter.log 2>&1 &

该命令将使得 Jupyter 在后台运行，并将日志写在 /data/jupyter/jupyter.log 文件中。

4.4 准备后续步骤的 Notebook

为了后面实验中实验室的步骤检查器能够更好的工作，此时我们使用以下命令预先创建几份 ipynb 文件：

cd /data/jupyter/root
cp Untitled.ipynb first.ipynb
cp Untitled.ipynb matplotlib.ipynb
cp Untitled.ipynb tensorflow.ipynb
rm -f Untitled.ipynb


5. 使用 Jupyter Notebook

5.1 打开 first.ipynb 编辑界面

接下来的步骤中如遇到步骤检查未通过，请按下 Ctrl + S 保存，等待步骤检查器确认。

编辑界面

• Jupyter Notebook 的编辑界面主要由 工具栏 和 内容编辑区 构成。

• 下方编辑区，由 Cell 组成。每个 notebook 由多个 Cell 构成，每个 Cell 都可以有不同的用途。

5.2 Code Cell

新建的 notebook 中包含一个代码 Cell（Code Cell），以“[ ]”开头，在该类型的 Cell 中，可以输入任意代码并执行。如输入：

1 + 1

然后按下 Shift + Enter 键， Cell 中代码就会被执行，光标也会移动至下个新 Cell 中。我们接着输入：print('Hello Jupyter')

再次按下 Shift + Enter ，可以看到这次没有出现 “Out[..]” 这样的文字。这是因为我们只打印出来了某些值，而没有返回任何的值。

按下 Ctrl + S 保存，等待步骤检查器确认。

5.3 Heading Cell

新版本中已经没有独立的 Heading Cell，现在标题被整合在 Markdown Cell 之中。

如果我们想在顶部添加一个的标题。选中第一个 Cell，然后点击 Insert -> Insert Cell Above 。

你会发现，文档顶部马上就出现了一个新的 Cell。点击在工具栏中 Cell 类型（默认为 Code），将其变成 Markdown。接着在 Cell 中写下：# My First Notebook然后按下 Shift + Enter 键，便可以看到生成了一行一级标题。

与 Markdown 语法相同，使用多个#将改变标题级别。

5.4 Markdown Cell

上一步中我们已经尝试了使用了 Markdown Cell。在该 Cell 中，除标题外其他语法同样支持。比如，我们在一个新的 Cell 中插入以下文本：

This is a **table**:
| Name | Value |
|:----:|:-----:|
| A | 1 |
| B | 2 |
| C | 3 |


然后按下 Shift + Enter，即可渲染出相应内容。

5.5 高级用法 - HTML

Markdown Cell 中同样接受 HTML 代码。这样，你就可以实现更加丰富的样式及结构、添加图片等等。

例如，如果想在 notebook 中添加 Jupyter 的 logo，并且添加 2px 的黑色边框，放置在单元格左侧，可以这样编写：

<img src="http://jupyter.org/assets/nav_logo.svg" style="border: 2px solid black; float:left" />

然后按下 Shift + Enter，即可渲染出图片。

5.6 高级用法 - LaTex

Markdown Cell 还支持 LaTex 语法。在 Cell 中插入以下文本：$$int_0^{+infty} x^2 dx$$同样按下 Shift + Enter，即可渲染出公式。

5.7 导出

notebook 支持导出导出为 HTML、Markdown、PDF 等多种格式。

如点击 File -> Download as -> HTML(.html)，即可下载到 HTML 版本的 notebook。

5.8 导出 PDF

其中，导出 PDF 需要其他包的支持，我们需要使用以下命令安装这些依赖：yum -y install pandoc texlive-*

• 注：直接导出 PDF 时 Jupyter 可能会忽略一些 Cell，建议先导出为 HTML，然后使用浏览器将其转为 PDF。

6. 集成 Matplotlib（可选）

Matplotlib 是 Python 中最常用的可视化工具之一，可以非常方便地创建许多类型的 2D 图表和基本的 3D 图表。

6.1 安装 Matplotlib

我们使用 pip 来安装 Matplotlib：pip install matplotlib

6.2 测试 Matplotlib

我们使用另一个 notebook （matplotlib.ipynb）来测试 Matplotlib。

点击这里打开 matplotlib.ipynb 编辑界面。

魔法命令：在第一个 Cell 中，我们插入并执行：%matplotlib inline

这是指定 matplotlib 图表的显示方式的魔法命令。inline 表示将图表嵌入到 notebook 中。

7. 测试

关于 Matplotlib 的使用请移步其官网。在接下来 Cell 中，我们插入几个官方示例测试：

7.1 plot_bmh：

示例代码：/plot_bmh.py

from numpy.random import beta
import matplotlib.pyplot as plt
plt.style.use('bmh')def plot_beta_hist(ax, a, b):
ax.hist(beta(a, b, size=10000), histtype="stepfilled",
bins=25, alpha=0.8, normed=True)fig, ax = plt.subplots()
plot_beta_hist(ax, 10, 10)
plot_beta_hist(ax, 4, 12)
plot_beta_hist(ax, 50, 12)
plot_beta_hist(ax, 6, 55)
ax.set_title("'bmh' style sheet")plt.show()


按 Shift + Enter 执行 Cell，即可看到绘制出的图像。

7.2 whats_new_99_mplot3d：

示例代码：/whats_new_99_mplot3d.py

import randomimport numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import cm
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3DX = np.arange(-5, 5, 0.25)
Y = np.arange(-5, 5, 0.25)
X, Y = np.meshgrid(X, Y)
R = np.sqrt(X**2 + Y**2)
Z = np.sin(R)fig = plt.figure()
ax = Axes3D(fig)
ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1, cmap=cm.viridis)plt.show()


同样执行 Cell，即可看到绘制出的图像。

7.3 动手试试

最后，我们来尝试绘制一个二次函数图像，你可以自行实现，也可以参考下面代码：

示例代码：/my.py

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as npx = np.arange(-10, 11)
y = x**2plt.plot(x, y)
plt.show()


8. 搭配 TensorFlow（可选）

TensorFlow™ 是一个采用数据流图，用于数值计算的开源软件库。它灵活的架构让你可以在多种平台上展开计算，例如台式计算机中的一个或多个CPU（或GPU），服务器，移动设备等等。

TensorFlow 最初由 Google 大脑小组的研究员和工程师们开发出来，用于机器学习和深度神经网络方面的研究，但这个系统的通用性使其也可广泛用于其他计算领域。

8.1 安装 TensorFlow

我们使用 pip 安装相关依赖及 Tensorflow

pip install protobuf

pip install tensorflow

8.2 测试 TensorFlow

关于 TensorFlow 的使用请移步其TensorFlow官网，这里只是测试其在 Jupiter 中是否可用

打开 tensorflow.ipynb 编辑界面。在 Cell 中加入以下代码（整理自官网 MNIST 教程）：

示例代码：/tensorflow.py

from tensorflow.examples.tutorials.mnist import input_data
import tensorflow as tf# The MNIST Data
mnist = input_data.read_data_sets("MNIST_data/", one_hot=True)# Regression
x = tf.placeholder(tf.float32, [None, 784])
W = tf.Variable(tf.zeros([784, 10]))
b = tf.Variable(tf.zeros([10]))
y = tf.nn.softmax(tf.matmul(x, W) + b)# Training
y_ = tf.placeholder(tf.float32, [None, 10])
cross_entropy = tf.reduce_mean(-tf.reduce_sum(y_ * tf.log(y), reduction_indices=[1]))
train_step = tf.train.GradientDescentOptimizer(0.05).minimize(cross_entropy)sess = tf.InteractiveSession()tf.global_variables_initializer().run()for _ in range(1000):
batch_xs, batch_ys = mnist.train.next_batch(100)
sess.run(train_step, feed_dict={x: batch_xs, y_: batch_ys})# Evaluating
correct_prediction = tf.equal(tf.argmax(y,1), tf.argmax(y_,1))
accuracy = tf.reduce_mean(tf.cast(correct_prediction, tf.float32))print(sess.run(accuracy, feed_dict={x: mnist.test.images, y_: mnist.test.labels}))


按下 Shift + Enter，学习过程结束后可以看到输出了准确率（92% 左右）。

恭喜！您已经成功搭建起了一个云端的 Jupyter Notebook 环境。你可以选择保留已经运行的服务，继续进行 Jupyter Notebook 的使用。