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关于linux命令uniq的信息
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Linux文本操作常用命令
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计linux命令uniq的命令linux命令uniq:
通过多敲键盘,形成手感 肌肉记忆 ,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令linux命令uniq的详细linux命令uniq的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加 符号,退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行,默认 10 行 (在R语言里head和tail默认是前6行)。
less命令用得最多 ,more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q键
less命令重要的补充用法2 :
参数用法:
less命令 不加参数 查看文件:
less命令加 -N参数 查看文件:显示行号
less命令加 -S参数 查看文件:单行显示,非常规整
对比:less和cat命令显示文本行号的用法:less -N,cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看,按空格翻页,按回车换行 ,more命令一般很少用,熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去,但是别的命令不一定会把换行符算进去,。
常见参数:
切记:用less命令,按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前:
排列后:
解释:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737小,所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时,因为制表符对齐的原因,出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样,所以 加上-n参数 , 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重,只有两行出现重复,而且是相邻的两行,如果不相邻,即使出现两行一模一样,不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之,uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1:
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯,原始数据不要轻易修改,修改的东西另外保存,文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ,然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上,将空格替换成制表符
补充小知识 :
清屏 :control L
查看历史(输入过的)命令 :history
相关问答
Q1: Linux里面uniq -c命令作用是什么?
uniq 对排序好linux命令uniq的内容进行去重
-c 显示输出中linux命令uniq,在每行行首加上本行在文件中出现linux命令uniq的次数。
Q2: linux命令分类总结
禁止在线上服务器使用
实例:
uniq命令可以去除排序过的文件中的重复行,因此uniq经常和sort合用。也就是说,为了使uniq起作用,所有的重复行必须是相邻的。
在一个指定的时间执行一个指定任务,只能执行一次,且需要开启atd进程
crond是linux下用来周期性的执行某种任务或等待处理某些事件的一个守护进程
将任务打入后台
示例:
vmstat是Linux中监控内存的常用工具,可对操作系统的虚拟内存、进程、CPU等的整体情况进行监视.
sar(System Activity Reporter系统活动情况报告)是目前 Linux 上最为全面的系统性能分析工具之一,可以从多方面对系统的活动进行报告,包括:文件的读写情况、系统调用的使用情况、磁盘I/O、CPU效率、内存使用状况、进程活动及IPC有关的活动等
常用:
Ping命令通过发送Internet控制消息协议(ICMP)回响请求消息来验证与另一台TCP/IP计算机的IP级连接
ss与netstat命令作用相同,但比netstat更高效,采用的是tcp协议栈中tcp_diag.
使用方法参考netstat,且基本参数相同
traceroute追踪网络数据包的路由途径
nslookup命令用于查询DNS的记录,查看域名解析是否正常,在网络故障的时候用来诊断网络问题
Q3: linux查看cpu核数和内存大小
linux查看cpu核数和内存大小命令分别为:
1、查看CPU个数*核心数:
cat /proc/cpuinfo | grep “physical id” | uniq | wc -l
96 #一共96核
2、查看内存总数
#cat /proc/meminfo | grep MemTotal
MemTotal: 230993600 kB
Linux下查看CPU型号,内存大小,硬盘空间的命令:
1、查看CPU核数
cat /proc/cpuinfo | grep “cpu cores” | uniq
cpu cores : 12 #12是单颗CPU的核心数
2、查看CPU型号
cat /proc/cpuinfo | grep ‘model name’ |uniq
model name : Intel® Xeon® CPU E7-4830 v3 @ 2.10GHz
3、查看linux物理内存数量及大小
dmidecode -t memory | grep Size: | grep -v “No Module Installed”
Q4: Linux系统sort和uniq命令联合使用
给定两个文件 a.txt 和 b.txt ,每行是一个记录(假设没有重复),要求输出两集合的交集、并集、差集,输出的结果只包括唯一项。
交集定义为同时出现在两个文件中的记录项;
并集定义为出现在任何一个文件中的记录项;
差集( A-B )定义为出现在A中而且不出现在B中的记录;
对称差集定义为只出现在一个文件中的记录;
假设 a.txt 包括 a, c, b 三行。假设 b.txt 包括 d, e, c, b 四行。
交集 ,把两个文件放到一起排序,只输出次数多于一次的项:
$ sort a.txt b.txt | uniq -d
并集 ,把两个文件放到一起排序,重复的项只算一次:
$ sort a.txt b.txt | uniq
差集(A-B) ,把B的元素重复2份和A的元素放到一起排序,只输出出现一次的项:
$ sort a.txt b.txt b.txt | uniq -u
对称差 ,把两个文件放到一起排序,只输出出现一次的项:
$ sort a.txt b.txt | uniq -u
指定分隔符(-t)及基于哪一列(-k)、基于数值(-n) 、逆序(-r)进行排序
#排序之后删除了重复行,同时在行首位置输出该行重复的次数:
执行命令:sort testfile | uniq -c ,输出结果如下
#仅显示存在重复的行,并在行首显示该行重复的次数:
执行命令:sort testfile | uniq -dc,输出结果如下
#仅显示没有重复的行:
执行命令:sort testfile | uniq -u,输出结果如下
Q5: linux命令uniq
uniq 命令
文字
uniq 是LINUX命令
用途
报告或删除文件中重复linux命令uniq的行。
语法
uniq [ -c | -d | -u ] [ -f Fields ] [ -s Characters ] [ -Fields ] [ +Characters ] [ InFile [ OutFile ] ]
描述
uniq 命令删除文件中linux命令uniq的重复行。
uniq 命令读取由
InFile 参数指定的标准输入或文件。该命令首先比较相邻的行linux命令uniq,然后除去第二行和该行的后续副本。重复的行一定相邻。(在发出 uniq
命令之前linux命令uniq,请使用 sort 命令使所有重复行相邻。)最后,uniq 命令将最终单独的行写入标准输出或由 OutFile
参数指定的文件。InFile 和 OutFile 参数必须指定不同的文件。如果输入文件用“-
”表示,则从标准输入读取;输入文件必须是文本文件。文本文件是包含组织在一行或多行中的字符的文件。这些行的长度不能超出
2048 个字节(包含所有换行字符),并且其中不能包含空字符。
缺省情况下,uniq 命令比较所有行。如果指定linux命令uniq了-f Fields 或 -Fields 标志, uniq 命令忽略由 Fields 变量指定的字段数目。 field 是一个字符串,用一个或多个 空格 字符将它与其它字符串分隔开。
如果指定了 -s Characters 或 -Characters 标志, uniq 命令忽略由 Characters 变量指定的字段数目。为 Fields 和 Characters 变量指定的值必须是正的十进制整数。
当前本地语言环境决定了 -f 标志使用的 空白 字符以及 -s 标志如何将字节解释成字符。
如果执行成功,uniq 命令退出,返回值 0。否则,命令退出返回值大于 0。
标志
-c 在输出行前面加上每行在输入文件中出现的次数。
-d 仅显示重复行。
-u 仅显示不重复的行。
-f Fields 忽略由 Fields 变量指定的字段数目。如果 Fields 变量的值超过输入行中的字段数目, uniq 命令用空字符串进行比较。这个标志和 -Fields 标志是等价的。
-s Characters
忽略由 Characters 变量指定的字符的数目。如果 Characters 变量的值超过输入行中的字符的数目, uniq
用空字符串进行比较。如果同时指定 -f 和 -s 标志, uniq 命令忽略由 -s Characters 标志指定的字符的数目,而从由 -f
Fields 标志指定的字段后开始。 这个标志和 +Characters 标志是等价的。
-Fields 忽略由 Fields 变量指定的字段数目。这个标志和 -f Fields 标志是等价的。
+Characters
忽略由 Characters 变量指定的字符的数目。如果同时指定 - Fields 和 +Characters 标志, uniq 命令忽略由
+Characters 标志指定的字符数目,并从由 -Fields 标志指定的字段后开始。 这个标志和 -s Characters
标志是等价的。
- c 显示输出中,在每行行首加上本行在文件中出现的次数。它可取代- u和- d选项。
- d 只显示重复行 。
- u 只显示文件中不重复的各行 。
- n 前n个字段与每个字段前的空白一起被忽略。一个字段是一个非空格、非制表符的字符串,彼此由制表符和空格隔开(字段从0开始编号)。
+ n 前n个字符被忽略,之前的字符被跳过(字符从0开始编号)。
- f n 与- n相同,这里n是字段数。
- s n 与+n相同,这里n是字符数。
退出状态
该命令返回以下退出值:
0 命令运行成功。
0 发生错误。
补充
文件经过处理后在它的输出文件中可能会出现重复的行。例如,使用cat命令将两个文件合并后,再使用sort命令进行排序,就可能出现重复行。这时可以使用uniq命令将这些重复行从输出文件中删除,只留下每条记录的唯一样
示例
要删除名为 fruit 文件中的重复行并将其保存到一个名为 newfruit 的文件中,输入:
uniq fruit newfruit
如果 fruit 文件包含下列行:
apples
apples
peaches
pears
bananas
cherries
cherries
则在您运行uniq 命令后 newfruit 文件将包含下列行:
apples
peaches
pears
bananas
cherries
文件/usr/bin/uniq 包含 uniq 命令。
# uniq -c 的用法,例如:
harley
casely
weedly
harley
linda
#cut -c 1-8 | sort | uniq -c result.txt
1 casely
2 harley
1 linda
1 weekly
1. 显示文件example中不重复的行。
uniq - u example
2. 显示文件example中不重复的行,从第2个字段的第2个字符开始做比较。
uniq - u - 1 +1 example
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